Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9bQ9D6E4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms