Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f1Q9D5Q6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f1Q9D5Q6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms