Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgms2Q9D4B1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Sgms2Q9D4B1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sgms2Q9D4B1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sgms2Q9D4B1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sgms2Q9D4B1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgms2Q9D4B1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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