Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
4933428G20RikQ9D3X4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms