Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrnp35Q9D384 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrnp35Q9D384 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrnp35Q9D384 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrnp35Q9D384 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrnp35Q9D384 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrnp35Q9D384 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrnp35Q9D384 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms