Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hddc3Q9D114 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Hddc3Q9D114 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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Hddc3Q9D114 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Hddc3Q9D114 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Hddc3Q9D114 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hddc3Q9D114 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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