Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm12Q9D0R8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms