Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc47Q9D024 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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