Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3300002I08RikQ9CXH3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms