Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ist1Q9CX00 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ist1Q9CX00 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ist1Q9CX00 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ist1Q9CX00 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms