Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tdrd12Q9CWU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms