Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms