Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc5Q9CQA1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms