Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rrbp1Q99PL5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rrbp1Q99PL5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rrbp1Q99PL5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms