Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcg5Q99PE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms