Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac9Q99N13 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms