Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms