Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajb11Q99KV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms