Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Emc3Q99KI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emc3Q99KI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms