Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf3aQ8VHT7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3aQ8VHT7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms