Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp4Q8VHC5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms