Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abca9Q8K449 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abca9Q8K449 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca9Q8K449 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms