Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk5rap2Q8K389 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cdk5rap2Q8K389 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk5rap2Q8K389 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms