Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd300eQ8K249 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd300eQ8K249 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms