Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp1Q8K021 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms