Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nupl2Q8CIC2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nupl2Q8CIC2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms