Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ep400Q8CHI8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ep400Q8CHI8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms