Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup88Q8CEC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup88Q8CEC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms