Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc17Q8CE13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc17Q8CE13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc17Q8CE13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms