Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E4f1Q8CCE9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E4f1Q8CCE9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms