Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc19Q8CC21 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc19Q8CC21 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc19Q8CC21 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms