Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spef2Q8C9J3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms