Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe22Q8C6A8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms