Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sall4Q8BX22 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall4Q8BX22 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms