Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms