Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cfap20Q8BTU1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap20Q8BTU1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms