Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zcchc4Q8BKW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms