Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htatsf1Q8BGC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms