Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd4Q8BFT6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms