Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pkhd1l1Q80ZA4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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