Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5bQ80Y84 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5bQ80Y84 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms