Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc155Q80VJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc155Q80VJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms