Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube2q1Q7TSS2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube2q1Q7TSS2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms