Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Clec18aQ7TSQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Clec18aQ7TSQ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Clec18aQ7TSQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec18aQ7TSQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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