Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc2aQ7TSC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc2aQ7TSC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms