Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim17Q7TPM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim17Q7TPM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms