Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sned1Q70E20 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms