Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup188Q6ZQH8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms