Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cand1Q6ZQ38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cand1Q6ZQ38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cand1Q6ZQ38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cand1Q6ZQ38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cand1Q6ZQ38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cand1Q6ZQ38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms