Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pprc1Q6NZN1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pprc1Q6NZN1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms